今年1月14日,BioMed Central旗下的BMC Cancer(2017-2018最新影响因子为3.288)第19期1卷正式刊登了我校信息工程学院生物信息教研室与福建医科大学合作的最新科研成果“Identifying primary site of lung-limited Cancer of unknown primary based on relative gene expression orderings”。
该研究发现的分类标志(五个基因对)可在原发灶未知的转移癌中识别其原发灶,指导临床治疗与用药。该教研室李红东博士为该论文第一通讯作者和共同第一作者,赣南医学院为该论文第一通讯单位。
转移癌的治疗通常采用和其原发灶类似的治疗策略。因此,精确诊断原发灶未知转移癌的原发病灶部位是临床上制定能够改善病人预后治疗策略的关键。该研究旨在开发能够预测原发灶未知转移癌的原发病灶部位的分子预测标志。
该研究利用结肠癌、肺癌、结肠癌肺转移样本,发现转移癌与其原发灶的转录组特征高度相似。以原位肺癌和结肠癌样本中基因间相对表达大小关系逆转的基因对作为参考,识别了五个基因对(GUCY2C和SLC34A2、CDH17和SLC34A2、FABP1和SLC34A2、KRT20和SLC34A2、USH1C和 SLC34A2),其对结肠癌肺转移样本有良好的鉴别能力,预测准确率达 100%。该研究下一步将分析转移癌的转移灶是否具有原发灶的转录组特征,为是否考虑转移灶联合用药提供方向。